Fondo Real Jardín Botánico
El Fondo reúne documentación cuyo rango de fechas va de 1775 a 1938.
El Real Jardín Botánico creado por Fernando VI en 1755, tiene su sede desde 1781 en el Paseo del Prado. Esta institución de carácter científico y docente está intimidante ligada a la historia del MNCN por ocuparse cada uno de los centros de las dos principales ramas de la biología: la botánica y la zoología respectivamente. En 1815 se aprueba un plan para la enseñanza de las ciencias naturales en un solo establecimiento público: el Real Museo de Ciencias Naturales. En este plan se incluye la cátedra de Botánica general. En 1857 se crea en el Museo un Gabinete Botánico. Los herbarios dependerán del catedrático de Fitografía y Organografía botánica y las colecciones organográficas y de especímenes vegetales estarán a cargo del catedrático de Organografía vegetal. Los reglamentos decimonónicos establecen la organización del Jardín como dependencia del Museo, y en el Reglamento de 1901 se crean las secciones de Herbarios y Cultivos. En 1910, el Jardín se separa del Museo, formando parte del Instituto Nacional de Ciencias Físico-Naturales hasta que, tras la Guerra Civil, formará parte del Consejo Superior de Investigaciones Científicas.
En el Archivo del MNCN se conserva la documentación generada por las Cátedras de Botánica (agrícola, médica y sistemática) que incluyen Planes de enseñanza, Expedientes personales, Correspondencia, Expedientes informativos y Expedientes de oposiciones; los documentos de la Junta de Protección del Museo relativa a las relaciones con el Jardín Botánico de la Habana, dirigido por Ramón de la Sagra; los Expedientes de ingresos y salidas e Inventarios del Herbario; y la serie Administración organizada en Personal, Informes, Expedientes de gestión administrativa y Expedientes de obras y reformas.