Fondo Museo
El Fondo Museo reúne la documentación generada por sus órganos de gobierno, administración y gestión desde su fundación hasta el presente. Comienza con una parte importante del archivo personal de Pedro Franco Dávila antes del traslado de su gabinete de París a Madrid, y continúa con toda la documentación producida por el desempeño de sus funciones en la recepción, organización y primera dirección del recién creado Real Gabinete de Historia Natural, fundado en pleno Siglo de las Luces, siglo singular por sus avances en la historia natural y el gusto por el coleccionismo.
Desde sus inicios (1771), el Real Gabinete reunió en la misma institución las funciones de museo, educación e investigación.
Recién iniciado el siglo XX, siendo director Ignacio Bolívar, se dicta en 1901 un nuevo reglamento donde se establecen por primera vez sus secciones científicas. En 1913, el Museo pasa a depender de la Junta de Ampliación de Estudios con el nombre de Museo Nacional de Ciencias Naturales. La última disposición oficial publicada antes de estallar la Guerra Civil, es el reglamento de 1930, que regula el Museo Nacional de Ciencias Naturales, el Antropológico y el Jardín Botánico.
Estos dos siglos y medio de historia de la Institución pueden consultarse en el Fondo Museo que se organiza en las siguientes series: Dirección; Junta de Profesores/Junta Directiva; Secretaría; Cátedras; Estaciones Experimentales Biológicas; Colecciones; Expediciones Científicas; Biblioteca y Archivo; y Exposiciones y Programas Públicos.